Công cụ “tin sinh học” (bioinformatics) xác định loài cá rô phi lai

Một công cụ đánh dấu bộ gen mới (genomics marker tool) đã được phát triển để xác định chính xác các loài cá rô phi và phân biệt sự lai tạp giữa các loài cá rô phi xâm lấn và cá rô phi bản địa. Phối hợp với Viện Nghiên cứu Thủy sản Tanzania, Đại học Roehampton, Đại học Bangor, Đại học Bristol và Đại học East Anglia ở Vương quốc Anh, Viện Earlham đã dẫn đầu việc phát triển một thiết kế tối ưu dựa trên 96 chỉ dấu sinh học đa hình nucleotide (SNP - single nucleotide polymorphisms), được chứng minh là chính xác hơn so với cách xác định hình thái học hoặc tế bào vi mô của các giống lai giữa các loài đặc trưng.

Tác giả chính, Tiến sĩ Adam Ciezarek, cho biết: “Điều quan trọng là có thể phát hiện ra những con lai này, nhưng thật không đáng tin cậy nếu tách chúng khỏi loài cá rô phi thuần chủng chỉ bằng các nhận dạng các đặc điểm vật lý. “Chúng tôi đã chứng minh rằng có thể xác định chúng bằng cách sử dụng dữ liệu bộ gen đầy đủ. Điều quan trọng, chúng tôi cũng đã chứng minh rằng một bộ 96 SNP được giảm thiểu đáng kể cũng có thể hoạt động tốt - với hiệu quả và độ chính xác cao hơn, đồng thời với chi phí thấp hơn nhiều"

Các dấu hiệu SNP mới cung cấp một nguồn quan trọng để đánh giá độ thuần chủng của tôm bố mẹ trong các trại sản xuất giống thủy sản, giúp bảo tồn đa dạng sinh học đặc hữu. Đây là một công cụ giá cả phải chăng và thuận tiện hơn có thể được sử dụng để khảo sát các vùng nước tự nhiên nhằm tìm bằng chứng lai giữa cá rô phi.

Đặc biệt, nhóm nghiên cứu hy vọng rằng công cụ này có thể giúp phát triển nuôi trồng thủy sản và nâng cao năng lực bảo tồn ở Tanzania, Châu Phi - một điểm nóng về đa dạng tự nhiên đối với các loài cá rô phi. Ít nhất tám loài Oreochromis đặc hữu hoàn toàn được tìm thấy ở Tanzania và thêm 12 loài đặc hữu của lưu vực có liên quan đến các nước láng giềng. Một số loài trong số này thích nghi với các điều kiện môi trường độc đáo (ví dụ, nhiệt độ cao, độ mặn và độ pH) và có thể được sử dụng cho việc phát triển nuôi trồng thủy sản trong tương lai.

Theo https://www.globalseafood.org